Семинария была образована в 1787 году на базе духовной школы при Белгородском архиерейском доме для обучения детей духовного сословия. Основателем её является епископ Белоградский и Курский Феоктист (Мочульский).
За 14 лет из семинарии вышло более 1000 выпускников разных классов в священнослужители, медицинскую науку, военную, статскую службу, в Харьковский университет при его основании сразу поступило 20 семинаристов. Первым ректором семинарии был игумен Белгородского Никольского монастыря Иустин. В период с 1787 по 1867 год семинарией управляли 13 ректоров. Вторым ректором в 1797 году стал иеромонах Хотмыжского монастыря Досифей, в следующем году - игумен Белгородского Николаевского монастыря Иеракс, затем в 1798 году его сменил протоиерей Иоанн Савченко. Отец Иоанн обладал ... великолепным проповедническим даром. Более двадцати его проповедей были отпечатаны и изданы как образцовые.
Священномученик Дамиан (Воскресенский) – один из самых известных выпускников Курской духовной семинарии. Её стены он покинул в далёком 1894 году, однако затем неоднократно возвращался в родной Курский край из других мест, где нёс своё служение: из Смоленска, Петербурга, Переславля-Залесского, Полтавы… А вот с Соловецких островов, превращённых в лагерь особого назначения (СЛОН), владыка в родные края уже не добрался. В 1937 году вместе с другими заключенными так называемого «первого соловецкого этапа» архиепископ Дамиан покинул Соловки и был расстрелян в глухом урочище Сандармох, в окрестностях города Медвежьегорск – столице Беломорканала.
Дорогие коллеги, отцы, братья и сестры!
В сложных кризисных обстоятельствах мы начинаем видеть свое настоящее лицо, мы понимаем, чего мы стоим. Как об этом говорили древние: «Amicus certus in re incerta cernitur». Или по-русски: «Друзья познаются в беде».